高等生物のゲノム配列にはタンパク質に翻訳されるエクソン領域とそれ以外のイントロン領域が存在し、その複雑な構造の中から機能部位を推定するのは大きな課題である。タンパク質配列にはその構造や機能と密接な関係がある特徴的な配列パターンであるモチーフが保存され、その情報は遺伝子配列にもよく保存されていると考えられる。本研究ではコドン縮約表現とその近似表現を用いた、動的計画 (DP) 法によるゲノム機能部位推定システムを開発した。本システムによって、イントロンを含むゲノム配列からも直接機能部位を推定できるようになった。
バイオインフォマティクス、ゲノム創薬
| 氏名 | 専攻 | 研究室 | 役職/学年 |
|---|---|---|---|
| 大友将宏 | 知能情報学専攻 | 数理生物情報研究領域 | 博士3回生 |
| 小林貴史 | その他: その他 | その他: その他 | |
| 加藤博明 | その他: その他 | 教授 |